Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax5Q02650 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms