Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms