Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrcdQ00LT2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms