Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms