Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms