Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcaP82350 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcaP82350 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcaP82350 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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