Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfybP63139 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfybP63139 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfybP63139 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfybP63139 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfybP63139 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfybP63139 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfybP63139 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NfybP63139 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfybP63139 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfybP63139 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfybP63139 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfybP63139 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NfybP63139 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfybP63139 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfybP63139 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfybP63139 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfybP63139 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfybP63139 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms