Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ppfia3P60469 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppfia3P60469 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms