Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3bP59470 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms