Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm2P58774 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm2P58774 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm2P58774 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm2P58774 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tpm2P58774 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm2P58774 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm2P58774 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm2P58774 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm2P58774 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm2P58774 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm2P58774 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm2P58774 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm2P58774 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm2P58774 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm2P58774 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpm2P58774 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tpm2P58774 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm2P58774 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm2P58774 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm2P58774 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm2P58774 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm2P58774 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm2P58774 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm2P58774 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm2P58774 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tpm2P58774 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tpm2P58774 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm2P58774 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm2P58774 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm2P58774 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms