Protein–RNA interactions for Protein: P35174

Stfa2, Stefin-2, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa2P35174 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa2P35174 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stfa2P35174 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms