Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde6aP27664 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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