Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms