Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifrd1P19182 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms