Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms