Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYL4P12829 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYL4P12829 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYL4P12829 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MYL4P12829 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
MYL4P12829 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYL4P12829 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYL4P12829 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms