Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms