Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlkO54988 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SlkO54988 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SlkO54988 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SlkO54988 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SlkO54988 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SlkO54988 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SlkO54988 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SlkO54988 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SlkO54988 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SlkO54988 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SlkO54988 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SlkO54988 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SlkO54988 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlkO54988 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlkO54988 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlkO54988 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SlkO54988 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlkO54988 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlkO54988 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlkO54988 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlkO54988 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlkO54988 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlkO54988 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlkO54988 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlkO54988 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SlkO54988 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SlkO54988 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SlkO54988 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SlkO54988 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SlkO54988 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SlkO54988 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SlkO54988 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SlkO54988 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SlkO54988 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlkO54988 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlkO54988 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlkO54988 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlkO54988 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlkO54988 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlkO54988 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlkO54988 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlkO54988 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SlkO54988 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SlkO54988 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms