Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms