Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrcpO35427 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CrcpO35427 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrcpO35427 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrcpO35427 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrcpO35427 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms