Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kpna4O35343 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna4O35343 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna4O35343 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna4O35343 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna4O35343 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna4O35343 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna4O35343 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna4O35343 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna4O35343 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna4O35343 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna4O35343 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna4O35343 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna4O35343 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms