Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
7530416G11RikJ3QJX6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
7530416G11RikJ3QJX6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms