Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms