Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3020E9Q3J7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3020E9Q3J7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms