Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms