Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm17333C6EQI3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm17333C6EQI3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm17333C6EQI3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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