Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms