Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttll9A2APC3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll9A2APC3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms