Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms