Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfap99A0A140LIX9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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