Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard6aQ9Z101 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Pard6aQ9Z101 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pard6aQ9Z101 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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