Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Cldn13Q9Z0S4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn13Q9Z0S4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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