Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y577

TRIM17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM17Q9Y577 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM17Q9Y577 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM17Q9Y577 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms