Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM35Q9UPQ4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms