Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTBN5Q9NRC6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms