Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Tgm1Q9JLF6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms