Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad9Q9JIW5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms