Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1Q9JIT0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1Q9JIT0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms