Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl28Q9JIL2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms