Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zcchc17Q9ESX4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc17Q9ESX4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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