Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde1Q9DBZ9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms