Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbe1Q9D6Y9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms