Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Rab11fip1Q9D620 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab11fip1Q9D620 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rab11fip1Q9D620 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rab11fip1Q9D620 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rab11fip1Q9D620 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Rab11fip1Q9D620 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Rab11fip1Q9D620 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rab11fip1Q9D620 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Rab11fip1Q9D620 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rab11fip1Q9D620 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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