Protein–RNA interactions for Protein: Q9D413

Sh2d6, SH2 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d6Q9D413 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d6Q9D413 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms