Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms