Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdm1Q9CQK3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms