Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM7Q9C029 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms