Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms