Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf48Q96LL4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms