Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin3bQ91ZU9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin3bQ91ZU9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin3bQ91ZU9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin3bQ91ZU9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin3bQ91ZU9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin3bQ91ZU9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin3bQ91ZU9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin3bQ91ZU9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin3bQ91ZU9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin3bQ91ZU9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin3bQ91ZU9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin3bQ91ZU9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin3bQ91ZU9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin3bQ91ZU9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin3bQ91ZU9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms